Laboratory tests in primary care · by Dr Solange Déplanque and Dr Michaël Rochoy

Sexually transmitted infections (STIs)

Infectious diseases · Prevention, screening, pregnancy · updated 2026-10-29

BioMG follows French guidelines. Adapt it to the guidelines and the tests available where you practise.

Frequency: In 2024, about 61 100 people were diagnosed and treated for Chlamydia trachomatis infection in the private sector in France (incidence of 89 per 100 000 inhabitants, 306 per 100 000 in women aged 15 to 25) and about 6 500 for syphilis [1].

Sexually transmitted infections (STIs)

Laboratory tests

On self-collected sample or first-catch urine

Urine tests

Detailed explanation and international comparison (in French): read it in English (machine translation)

Do not order

Screening without a prescription (under 26 years, France)

At the laboratory, at the patient's request, without prescription or appointment (“Mon test IST”)

On self-collected vaginal or anal sample, or first-catch urine (pharyngeal sample possible by a professional)

Detailed explanation and international comparison (in French): read it in English (machine translation)

Screening of an asymptomatic person

Laboratory tests

On self-collected vaginal sample, first-catch urine or anal or pharyngeal swab

Detailed explanation and international comparison (in French): read it in English (machine translation)

Do not order

Sources (35)
  1. Santé publique France. Surveillance du VIH et des IST bactériennes en France en 2024. Bulletin, édition nationale, 23 octobre 2025.
  2. Caisse nationale de l’assurance maladie. Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM), version 105 : actes 5301 à 5303 (recherche de Chlamydia trachomatis et/ou Neisseria gonorrhoeae par amplification génique, 1, 2 ou 3 sites).
  3. Pilly - Item 162
  4. Diagnostic biologique des mycoplasmes urogénitaux dans les infections génitales basses – Rapport d'évaluation - Actualisation d'avril 2025
  5. Société de pathologie infectieuse de langue française (SPILF). Diagnostic et antibiothérapie des infections urinaires bactériennes communautaires de l’adulte. Mise au point, actualisation au 11 décembre 2015.
  6. Haute Autorité de santé, SPILF. Choix et durées d'antibiothérapies : cystite aiguë simple, à risque de complication ou récidivante, de la femme. Fiche mémo, validée le 15 juillet 2021, mise à jour le 13 mai 2025.
  7. Haute Autorité de santé. Hépatite C : prise en charge simplifiée chez l’adulte. Fiche mémo, mars 2019 (mise à jour septembre 2019).
  8. Haute Autorité de santé, Conseil national du sida et des hépatites virales, ANRS-MIE. Traitement préventif post-exposition au VIH. Recommandation de bonne pratique, validée par le Collège le 25 juillet 2024.
  9. Remy AJ, Bellon S, Smadhi R, et al. Dépist C Endo : dépister l’hépatite C avant endoscopie en consultation externe d’hépato-gastro-entérologie. Bulletin épidémiologique hebdomadaire. 2023;(15-16).
  10. Conseil national du sida et des hépatites virales, ANRS-MIE, labellisé par la Haute Autorité de santé. Recommandations de prise en charge des personnes ayant une syphilis. Recommandations de bonne pratique, mai 2025.
  11. Aaron, K. J., Griner, S., Footman, A., Boutwell, A., & Van Der Pol, B. (2023). Vaginal swab vs urine for detection of Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, and Trichomonas vaginalis: A meta-analysis. The Annals of Family Medicine, 21(2), 172-179
  12. Haute Autorité de santé. Réévaluation de la stratégie de dépistage des infections à Chlamydia trachomatis. Recommandation en santé publique, mise en ligne le 23 octobre 2018.
  13. Assurance maladie (ameli.fr, espace Laboratoires d’analyses médicales). Dépistage des IST en laboratoire sans ordonnance : Mon test IST. Page consultée le 11 octobre 2026.
  14. Haute Autorité de santé. Évaluation des stratégies de dépistage des personnes infectées par le virus de l’hépatite C (VHC), volet 1 : efficience des stratégies de dépistage. 2019.
  15. Jespers V, Stordeur S, Desomer A, et al. Prise en charge en 1re ligne des infections sexuellement transmissibles : développement d’un outil interactif d’aide à la consultation. Synthèse. Bruxelles : Centre fédéral d’expertise des soins de santé (KCE), 2019. KCE Reports 321Bs.
  16. Ministère de la Santé et des Services sociaux du Québec. Guide québécois de dépistage des infections transmissibles sexuellement et par le sang. Mise à jour de juillet 2019 (publication 19-308-13W).
  17. Coleman H, Samuel I, Soni S, et al. BASHH Summary Guidance on Testing for Sexually Transmitted Infections, 2023. British Association for Sexual Health and HIV (Royaume-Uni), 2023.
  18. Australasian Society for HIV, Viral Hepatitis and Sexual Health Medicine (ASHM). Australian STI Management Guidelines for Use in Primary Care : Standard Asymptomatic Check-up. Page mise à jour le 30 juin 2026, consultée le 29 octobre 2026.
  19. Garvey L, Bhagani S, Kulasegaram R, et al. British Association for Sexual Health and HIV (BASHH) guidelines on the management of viral hepatitis 2026. Int J STD AIDS. 2026 (publication en ligne).
  20. US Preventive Services Task Force. Screening for Hepatitis C Virus Infection in Adolescents and Adults: US Preventive Services Task Force Recommendation Statement. JAMA. 2020;323(10):970-975.
  21. Workowski KA, Bachmann LH, Chan PA, et al. Sexually Transmitted Infections Treatment Guidelines, 2021. MMWR Recomm Rep. 2021;70(4):1-187.
  22. Conners EE, Panagiotakopoulos L, Hofmeister MG, et al. Screening and Testing for Hepatitis B Virus Infection: CDC Recommendations - United States, 2023. MMWR Recomm Rep. 2023;72(1):1-25.
  23. Caisse nationale de l’assurance maladie. Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM), version 105 : acte 1307 (sérologie de Chlamydia trachomatis).
  24. Caisse nationale de l’assurance maladie. Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM), version 105 : actes 0393 à 0396, 1356-1357, 5311 à 5313, 5500-5501.
  25. Décret n° 2024-725 du 5 juillet 2024 relatif à la participation des assurés aux frais liés au dépistage de l’infection par le virus de l’immunodéficience humaine et des autres infections sexuellement transmissibles mentionnées à l’article L. 162-13-2 du code de la sécurité sociale. Journal officiel du 7 juillet 2024, texte 29.
  26. Assurance maladie (ameli.fr, espace Assurés). Dépister les IST. Page consultée le 11 octobre 2026.
  27. Arrêté du 8 juillet 2024 fixant la liste des infections sexuellement transmissibles dépistées à la demande du patient en laboratoire de biologie médicale et les modalités de ces dépistages.
  28. Phung B-C. Recommandations de dépistage des IST en France. Séminaire Santé sexuelle, SMIT Bichat, 24 septembre 2025 (diaporama hébergé par la SPILF ; reprend les recommandations HAS de 2009, 2011, 2017 et 2018 et les données de Santé publique France 2022).
  29. Haute Autorité de santé. Évaluation a priori du dépistage de la syphilis en France. Recommandation en santé publique, argumentaire, 2007.
  30. Haute Autorité de santé. Bon usage du médicament : la prophylaxie pré-exposition (PrEP) au VIH par ténofovir disoproxil/emtricitabine (Truvada et ses génériques). Mise à jour avril 2019.
  31. Haute Autorité de santé. Réévaluation de la stratégie de dépistage de l’infection à VIH en France. Synthèse et conclusions de la recommandation en santé publique, mars 2017.
  32. Haute Autorité de santé. Stratégies de dépistage biologique des hépatites virales B et C. Recommandation en santé publique, synthèse, janvier 2012 (évaluation de 2011).
  33. US Preventive Services Task Force. Screening for Chlamydia and Gonorrhea: US Preventive Services Task Force Recommendation Statement. JAMA. 2021;326(10):949-956.
  34. US Preventive Services Task Force. Screening for Syphilis Infection in Nonpregnant Adolescents and Adults: US Preventive Services Task Force Reaffirmation Recommendation Statement. JAMA. 2022;328(12):1243-1249.
  35. Bébéar C. Mycoplasma genitalium : quand le rechercher ? Journées SPILF 2019