Prélèvement mycologique : onychomycose, teigne

Dermatologie · Symptôme ou situation · mise à jour le 29/10/2026

Fréquence : Onychomycose : 6 à 9 % de la population générale, 30 % après 70 ans ^[1]

Onychomycose (avant tout traitement)

Pourquoi prélever. Une onychopathie n'est pas forcément une mycose : l'onychomycose ne représente que 18 à 50 % des atteintes des ongles selon les séries (traumatismes, psoriasis…) ^[1]. La Société française de dermatologie insiste sur l'obligation d'un prélèvement mycologique systématique, avant tout traitement local et a fortiori systémique ; le laboratoire doit rendre l'examen direct et la culture ^[1]. Ne jamais commencer le traitement d'une onychomycose sans le résultat d'au moins l'examen direct et de la culture ^[1]. Le coût de l'examen est négligeable comparé à celui d'un traitement antifongique empirique ou inadapté ^[1].

Conditions du prélèvement ^[1] :

• fenêtre thérapeutique de 3 mois après une solution filmogène, un vernis ou un traitement systémique ;
• ongles propres, brossés au savon neutre le jour de l'examen ;
• de préférence dans un laboratoire habitué à ces prélèvements : le prélèvement est l'étape critique, et des laboratoires non spécialisés rendent encore des faux négatifs ou des faux positifs.

Délai du résultat : l'examen direct répond en quelques heures ; la culture, seule à identifier l'espèce, demande quelques jours pour les levures et les moisissures, 2 à 3 semaines pour les dermatophytes ^[1].

Interpréter ^[1] :

• examen direct négatif et culture stérile : onychopathie non fongique (environ la moitié des cas) ;
• filaments à l'examen direct et dermatophyte en culture : dermatophytose (plus de 90 % des prélèvements positifs des orteils) ;
• Candida albicans aux doigts : pathogène (absent de la peau saine) ; autres levures en petit nombre : ne pas en tenir compte ;
• moisissure en culture pure avec filaments à l'examen direct : refaire le prélèvement, qui doit redonner le même résultat ;
• filaments à l'examen direct et culture stérile : refaire le prélèvement ;
• en cas de doute sur le résultat, répéter l'examen avant toute décision thérapeutique.

Examen direct et culture négatifs malgré une forte suspicion : refaire le prélèvement ^[1]. L'examen histologique d'un fragment d'ongle coloré au PAS ne contribue au diagnostic que s'il inclut la zone infectée et le lit de l'ongle, et n'identifie pas le champignon ^[1] ; dans une méta-analyse, c'était le test le plus sensible (84 %, contre 56 % pour la culture), les auteurs concluant qu'il faut combiner les examens ^[2].

Contrôle : la guérison s'apprécie cliniquement ; en cas de doute, attendre une fenêtre thérapeutique de 3 à 6 mois avant un prélèvement de contrôle ^[1].

Avant terbinafine : rechercher une pathologie hépatique ^[1] (voir la fiche « Traitement : terbinafine »). Dans une étude rétrospective de 4 985 patients traités par terbinafine ou griséofulvine pour une dermatophytie, les anomalies des transaminases et de la NFS sous traitement n'étaient pas plus fréquentes qu'avant traitement ; les auteurs jugent inutile une surveillance biologique systématique en l'absence de maladie hépatique ou hématologique sous-jacente ^[3].

Ailleurs dans le monde : aux États-Unis, la notice de la terbinafine demande aussi un prélèvement de l'ongle avant de traiter une onychomycose (examen direct à la potasse, culture ou biopsie) ^[4], et l'American Family Physician recommande de confirmer le diagnostic avant tout traitement par l'un de ces examens ou par PCR (accord d'experts) ^[5]. Une revue antérieure de la même revue juge l'examen direct seul suffisant pour commencer, d'autres examens n'étant utiles que s'il revient négatif malgré une forte suspicion ^[6] (choix coût-efficacité : examen rapide, spécifique et peu coûteux). En Allemagne, la recommandation S1 de 2023 associe examen direct, culture et/ou biologie moléculaire ^[7].

Teigne du cuir chevelu (enfant, entourage)

Prouver la teigne. Le diagnostic de teigne devrait reposer sur un examen mycologique ^[9]. Prélever avant tout antifongique : seule la culture identifie précisément le champignon (genre et espèce) ^[1], et la teigne peut venir d'une personne, d'un animal ou du sol ^[9].

Commencer sans attendre si le tableau est typique (kérion, squames avec alopécie et adénopathies) : la culture demande 2 à 4 semaines, et il est raisonnable de débuter le traitement oral sur les signes cardinaux en attendant la mycologie ^[8]. Le traitement local seul ne suffit pas ^[8].

Contrôler la guérison mycologique : l'objectif est la guérison mycologique et non seulement clinique ; refaire le prélèvement jusqu'à sa négativation ^[8].

Collectivité ^[9] :

• éviction jusqu'à présentation d'un certificat médical attestant une consultation et la prescription d'un traitement adapté ;
• recommander aux personnes contact (famille, entourage, professionnels) de consulter pour un dépistage ;
• hygiène stricte, nettoyage des jouets ; les teignes zoophiles se transmettent par contact avec l'animal.

La contagiosité est faible et dure jusqu'à la guérison des lésions ; l'incubation est de 2 à 3 semaines ^[9].

Ailleurs dans le monde : le Royaume-Uni retient, comme la France, la guérison mycologique comme objectif et le dépistage de tout l'entourage en cas de T. tonsurans ^[8]. En Allemagne, la recommandation de consensus de 2026 étend l'examen mycologique à tous les membres de la famille et aux contacts proches, même asymptomatiques, quand le champignon se transmet d'homme à homme, privilégie l'association examen direct et PCR pour aller vite, et refait l'examen mycologique toutes les 4 semaines jusqu'à la négativation de la culture ^[10]. Aux États-Unis, une revue de l'American Family Physician (2014) déconseille à l'inverse de prélever les membres asymptomatiques du foyer, qu'elle propose de traiter par un shampooing antifongique, et juge en général inutile une culture de contrôle si l'enfant s'améliore ^[11] (avis d'experts, prise en charge empirique de l'entourage).

Dermatophytie cutanée étendue ou qui ne guérit pas sous terbinafine (Trichophyton indotineae)

Reconnaître. Depuis 2017, des dermatophyties étendues du tronc, des plis inguinaux, des fesses et des membres, très prurigineuses, résistantes à la terbinafine, sont décrites en France chez des patients originaires du sous-continent indien (Bangladesh, Inde, Sri Lanka) ou y ayant séjourné ; elles sont dues à Trichophyton indotineae ^[12,13]. La transmission est surtout interhumaine, et des cas sont apparus après plusieurs années de vie en France ^[12].

Pourquoi prélever. Seule la culture identifie l'espèce ^[1]. Dans une série française, 57 % des isolats de T. indotineae étaient résistants à la terbinafine ^[12] ; dans une autre, à l'hôpital Saint-Louis, l'itraconazole donnait souvent une amélioration initiale mais des rechutes, avec persistance mycologiquement confirmée chez au moins 4 patients sur 7 ^[13]. Pour ces auteurs, l'enjeu est d'identifier l'espèce plutôt que de demander en routine la mesure des concentrations minimales inhibitrices ^[13] : préciser le contexte au laboratoire, qui adressera la souche à un laboratoire spécialisé si besoin.

Adresser au dermatologue une dermatophytie étendue qui ne guérit pas sous un traitement bien conduit : le traitement optimal des formes résistantes n'est pas établi ^[13].

Hors de ce contexte, l'antifongigramme n'a pas d'intérêt en pratique courante (voir l'onglet « Onychomycose ») ^[1].

Ailleurs dans le monde : un consensus international d'experts (méthode Delphi, 2026) recommande examen direct et culture, puis une PCR qui distingue l'espèce ou un séquençage pour confirmer T. indotineae, et, là où c'est possible, une étude de la sensibilité aux antifongiques ou la recherche de mutations du gène SQLE, surtout après un échec du traitement ^[14] (avis d'experts ; les auteurs français cités plus haut privilégient l'identification de l'espèce). Aux États-Unis, l'American Family Physician signale en 2025 la progression des infections à T. rubrum résistant à la terbinafine, onychomycoses comprises ^[5].

Sources

1. Société française de dermatologie. Onychomycoses : modalités de diagnostic et prise en charge. Ann Dermatol Venereol. 2007;134(5 Pt 2):5S7-16.
2. Velasquez-Agudelo V, Cardona-Arias JA. Meta-analysis of the utility of culture, biopsy, and direct KOH examination for the diagnosis of onychomycosis. BMC Infect Dis. 2017;17(1):166.
3. Stolmeier DA, Stratman HB, McIntee TJ, Stratman EJ. Utility of laboratory test result monitoring in patients taking oral terbinafine or griseofulvin for dermatophyte infections. JAMA Dermatol. 2018;154(12):1409-16.
4. US Food and Drug Administration (DailyMed). Terbinafine tablets, USP 250 mg (Cipla USA) : prescribing information, rubrique 1 (Indications and usage), version du 19 septembre 2025.
5. Caplan AS, Gold JAW, Smith DJ, Ely JW. Diagnosis and management of tinea infections. Am Fam Physician. 2025;112(4):382-392.
6. Frazier WT, Santiago-Delgado ZM, Stupka KC 2nd. Onychomycosis: rapid evidence review. Am Fam Physician. 2021;104(4):359-367.
7. Nenoff P, Reinel D, Mayser P, et al. S1 Guideline onychomycosis. J Dtsch Dermatol Ges. 2023;21(6):678-692.
8. Fuller LC, Barton RC, Mohd Mustapa MF, Proudfoot LE, Punjabi SP, Higgins EM. British Association of Dermatologists' guidelines for the management of tinea capitis 2014. Br J Dermatol. 2014;171(3):454-63.
9. Haut Conseil de la santé publique. Survenue de maladies infectieuses dans une collectivité. Guide des conduites à tenir en cas de maladies infectieuses dans une collectivité d'enfants ou d'adultes. Rapport du 28 septembre 2012 ; fiche « Teignes du cuir chevelu et de la peau ».
10. Mayser P, Abeck D, Bosshard PP, et al. Consensus-based guideline on tinea capitis. J Dtsch Dermatol Ges. 2026;24(10):e1510-e1522.
11. Ely JW, Rosenfeld S, Seabury Stone M. Diagnosis and management of tinea infections. Am Fam Physician. 2014;90(10):702-710.
12. Jabet A, Brun S, Normand AC, et al. Extensive dermatophytosis caused by terbinafine-resistant Trichophyton indotineae, France. Emerg Infect Dis. 2022;28(1):229-33.
13. Dellière S, Joannard B, Benderdouche M, et al. Emergence of difficult-to-treat tinea corporis caused by Trichophyton mentagrophytes complex isolates, Paris, France. Emerg Infect Dis. 2022;28(1):224-8.
14. Gupta AK, Talukder M, Saunte DML, et al. Consensus recommendations for Trichophyton indotineae: a modified Delphi study. J Eur Acad Dermatol Venereol. 2026 (publié en ligne le 25 septembre 2026).