MICI

Gastro-entérologie-hépatologie · Maladie connue · mise à jour le 31/10/2026

Fréquence : 0,43 % de la population dans le nord de la France en 2020 (0,31 % en 2010), d'après le registre EPIMAD ^[1] ; environ 315 000 malades en France selon l'Observatoire national des MICI, association de patients ^[2]

Bilan initial

Bilan à réaliser à jeun.

Les bilans indiqués ci-dessus suivent les recommandations européennes ECCO-ESGAR 2019, d'après leur synthèse française ^[4].

La HAS (document « Actes et prestations » des ALD, mai 2019) liste les examens du bilan initial et du suivi sans en fixer le rythme. Maladie de Crohn : ionogramme (bilan initial), NFS-plaquettes, CRP, albuminémie, ALAT, gamma-GT, phosphatases alcalines et créatininémie avec DFG, ferritinémie en première intention (coefficient de saturation de la transferrine en deuxième intention) ^[8]. Rectocolite hémorragique : mêmes examens, l'albuminémie figurant au suivi ^[9].

Les recommandations françaises de pratique vont dans le même sens. Pour la maladie de Crohn : NFS, CRP et éventuellement calprotectine fécale, coproculture et recherche de C. difficile, autres analyses de selles après un voyage récent ; le statut vaccinal est évalué et la tuberculose latente dépistée dès le diagnostic ^[5]. Pour la RCH : hémogramme, CRP et éventuellement calprotectine fécale, bilan hydroélectrolytique, hépatique et martial, albuminémie et vitamine D ; examen parasitologique des selles en cas de voyage en zone d'endémie et dépistage des IST si le contexte l'évoque ^[3]. Une CRP basse associée à une calprotectine basse a une valeur prédictive négative de 99 % pour la maladie de Crohn ^[5].

Au diagnostic, la calprotectine n'est pas remboursée ; la HAS n'a pas pu dégager en 2020 de jugement consensuel sur son intérêt pour le diagnostic étiologique de troubles digestifs chroniques ^[7].

La calprotectine fécale (acte 1684) est remboursée seulement chez un patient dont la MICI est connue, sans rectorragie ni CRP élevée, dans la limite de deux dosages par an, sur prescription d'un hépato-gastro-entérologue ou d'un pédiatre ^[6] ; le Quantiféron (acte 4103) est remboursé avant l'instauration d'un anti-TNF ou d'un anti-JAK ^[6].

Les tests génétiques et les sérologies (ASCA/ANCA) ne sont pas recommandés pour le diagnostic de routine de MC ou de RCH ^[4,5].

Les sérologies de la varicelle et de la rougeole ainsi que le dépistage de l’hépatite B doivent être réalisés. Une vaccination pourra être proposée si nécessaire. Il est important de rappeler que les vaccins de la rougeole et de la varicelle sont des vaccins vivants, en tant que tels ils sont contre indiqués chez des patients immunodéprimés et ne pourront donc être réalisés qu’avant une mise sous traitement. Il est également recommandé de réaliser au diagnostic les sérologies VHC, EBV, CMV et VIH.

Position de la synthèse FMC-HGE : bilan initial NFS, plaquettes, CRP, calprotectine fécale, ionogramme, urée, créatininémie, albuminémie, ferritinémie, coefficient de saturation de la transferrine, vitamines B12 et B9, sérologies VHB, rougeole, varicelle, VHC, EBV, CMV, VIH, Quantiféron, coproculture et toxines de C. difficile ; seuil de calprotectine retenu pour le diagnostic : 150 µg/g ; sérologies ASCA/ANCA et tests génétiques non recommandés en routine ^[4]. Une CRP normale n'élimine ni la maladie de Crohn ni la RCH ^[4]. La recherche de tuberculose n'est pas stipulée dans le consensus ECCO ; la synthèse indique qu'elle pourrait être proposée dans le même temps ^[4] ; son remboursement est prévu avant anti-TNF ou anti-JAK ^[6]. Ces éléments sont rapportés d'après la synthèse française du consensus ECCO-ESGAR ^[4].

Avant biothérapie ou inhibiteur de JAK, voir la fiche « Biothérapie ou inhibiteur de JAK : bilan avant traitement et surveillance ». Pour la TPMT avant azathioprine, voir la fiche « Pharmacogénétique ». Selon le RCP de l'azathioprine (Imurel), l'hémogramme est contrôlé avant le traitement, chaque semaine pendant huit semaines, puis mensuellement ou au plus tous les trois mois ^[10].

Ailleurs dans la francophonie : au Québec, l'INESSS a admis en 2014 le dosage de la calprotectine fécale pour distinguer une MICI d'un syndrome du côlon irritable, y compris sur prescription du médecin de famille, mais demande de ne pas le prescrire chez l'adulte qu'on n'envisage pas d'adresser au spécialiste ni en cas de cancer possible ^[11].

Divergences : la synthèse du consensus ECCO-ESGAR place la calprotectine fécale dans le bilan initial ^[4] ; les recommandations françaises sur la maladie de Crohn et sur la rectocolite hémorragique la citent « éventuellement » ^[3,5] ; la HAS (2020) n'a pas dégagé de jugement consensuel sur son intérêt pour le diagnostic de troubles digestifs chroniques ^[7]. Elle figure donc en option sur l'ordonnance du bilan initial.

Ailleurs dans le monde : aux États-Unis, l'ACG (2025) recommande fortement la calprotectine fécale, au seuil de 50 à 100 µg/g, pour distinguer une inflammation du côlon d'un trouble non inflammatoire, et fait rechercher pathogènes et C. difficile dans les selles devant des symptômes évocateurs ^[12,13]. Le NICE la retient dès les soins primaires chez l'adulte aux symptômes digestifs bas récents pour qui un avis spécialisé est envisagé, si un cancer n'est pas suspecté ^[14], et la JSGE japonaise la juge utile pour distinguer une MICI d'un syndrome de l'intestin irritable ^[15] ; en France, les recommandations la citent « éventuellement » et elle n'est pas remboursée au diagnostic ^[3,5,6] (choix de remboursement). L'ACG déconseille aussi les sérologies (ASCA, ANCA) pour le diagnostic de la RCH ^[13]. Selon l'ACG, on recherche une tuberculose avant un anti-TNF, par IGRA de préférence chez le sujet vacciné par le BCG, et une hépatite B (Ag HBs, anticorps anti-HBc et anti-HBs) avant la plupart des traitements avancés ; les vaccinations sont revues dès le diagnostic ^[12].

Surveillance

A réaliser tous les 3 à 6 mois pour anticiper une poussée

Les bilans indiqués ci-dessus suivent les recommandations européennes ECCO-ESGAR 2019, d'après leur synthèse française ^[4].

La HAS (document « Actes et prestations » des ALD, mai 2019) liste les examens du bilan initial et du suivi sans en fixer le rythme. Maladie de Crohn : ionogramme (bilan initial), NFS-plaquettes, CRP, albuminémie, ALAT, gamma-GT, phosphatases alcalines et créatininémie avec DFG, ferritinémie en première intention (coefficient de saturation de la transferrine en deuxième intention) ^[8]. Rectocolite hémorragique : mêmes examens, l'albuminémie figurant au suivi ^[9].

Intervalle de surveillance proposé par le consensus ECCO : 3 à 6 mois en rémission, selon la durée de la rémission et les traitements en cours ; la calprotectine fécale est évoquée tous les 3 mois, car elle s'élève environ 3 mois avant les signes cliniques de rechute ; une calprotectine élevée chez un patient asymptomatique doit être confirmée par coloscopie ou entéro-IRM ; seuil utilisé en vie réelle pour modifier le traitement : 250 µg/g ^[4].

La recommandation française sur la maladie de Crohn retient le même intervalle de 3 à 6 mois en rémission, selon la durée de la rémission et le traitement ; calprotectine et CRP détectent la rechute avant les symptômes ^[5]. Aucun seuil de calprotectine ne fait consensus : de l'ordre de 100 µg/g dans les essais, 250 µg/g en vie réelle. Dans la zone cible, contrôle à 3 mois ; valeur élevée : adaptation du traitement et contrôle le mois suivant ; zone grise : nouveau dosage dans un délai d'un mois avant toute décision ; après chirurgie, cible inférieure à 100 µg/g ^[5]. Une CRP inférieure à 5 mg/L est un objectif du traitement à 3 mois ^[5].

Toute suspicion de poussée impose une coproculture et une recherche de C. difficile ; au retour d'une zone d'endémie, on y ajoute un examen parasitologique des selles sur 3 jours et une sérologie d'anguillulose ^[5].

Ailleurs dans la francophonie : en Belgique, le dosage de la calprotectine fécale n'est remboursé que pour le suivi d'une maladie de Crohn avérée (pas de la RCH), sur prescription d'un spécialiste d'une discipline de pathologie interne, deux fois par an au plus ^[16].

Ailleurs dans le monde : aux États-Unis, l'ACG (2025) recommande fortement la calprotectine fécale pendant le traitement d'entretien de la RCH ^[13] ; chez le malade de Crohn en rémission, l'AGA (2023) associe biomarqueurs et symptômes : une calprotectine < 150 µg/g avec une CRP normale écarte une inflammation active, et une valeur élevée se confirme par endoscopie avant de modifier le traitement ^[17]. Au Royaume-Uni, d'après une revue de la recommandation BSG 2025, une calprotectine < 100 µg/g peut traduire une rémission endoscopique et une valeur > 200 µg/g fait discuter une nouvelle coloscopie ^[18] : les seuils diffèrent selon les sociétés savantes ^[17,18] (niveau de preuve). Au Japon, la JSGE juge aussi le test immunologique fécal (hémoglobine) utile pour suivre une RCH en rémission ^[15], un test sans acte dans la nomenclature française ^[6] (autre organisation des soins).

Sources

1. Sarter H, Crétin T, Savoye G, et al. Incidence, prevalence and clinical presentation of inflammatory bowel diseases in Northern France: a 30-year population-based study. Lancet Reg Health Eur 2024;47:101097.
2. LES MICI EN FRANCE
3. Amiot A, Viennot S, Uzzan M, et al. Recommandations de pratique pour le diagnostic et la prise en charge de la rectocolite hémorragique (version longue), GETAID. Hepato Gastro Oncol Dig 2022;29:e297-e351.
4. Diagnostic initial, suivi des MICI et détection des complications
5. Bouguen G, Gornet JM, Hamoudi N, et al. Recommandations françaises pour la prise en charge de la maladie de Crohn, version longue. GETAID, avril 2024 (Hepatogastroenterol Oncol Dig 2024;31:1-52).
6. Assurance maladie. Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM), version 105 : actes 1684 (calprotectine fécale), 4103 (IGRA), 1804 (CRP), 1033 (Clostridioides difficile).
7. Haute Autorité de santé. Intérêt du dosage de calprotectine fécale pour le diagnostic étiologique de troubles digestifs chroniques survenant chez des sujets de moins de 50 ans sans signe d'alarme ni élévation de la CRP. Rapport d'évaluation, mai 2020.
8. Haute Autorité de santé. Actes et prestations – affection de longue durée n° 24 : maladie de Crohn. Mise à jour mai 2019.
9. Haute Autorité de santé. Actes et prestations – affection de longue durée n° 24 : rectocolite hémorragique évolutive. Mise à jour mai 2019.
10. ANSM, Base de données publique des médicaments. Résumé des caractéristiques du produit IMUREL 50 mg (azathioprine), rubriques 4.2 et 4.4, consulté le 13 octobre 2026.
11. Institut national d'excellence en santé et en services sociaux (INESSS, Québec). Dosage de la calprotectine fécale. Avis d'évaluation (réf. 2013-03-005), avis transmis au ministre le 28 février 2014.
12. Lichtenstein GR, Loftus EV, Afzali A, Long MD, Barnes EL, Isaacs KL, Ha CY. ACG Clinical Guideline: Management of Crohn's Disease in Adults. Am J Gastroenterol 2025;120(6):1225-1264.
13. Rubin DT, Ananthakrishnan AN, Siegel CA, Barnes EL, Long MD. ACG Clinical Guideline Update: Ulcerative Colitis in Adults. Am J Gastroenterol 2025;120(6):1187-1224.
14. National Institute for Health and Care Excellence. Faecal calprotectin diagnostic tests for inflammatory diseases of the bowel. HealthTech guidance HTG320 (ex-diagnostics guidance DG11), publiée le 2 octobre 2013, texte inchangé.
15. Nakase H, Uchino M, Shinzaki S, et al. Evidence-based clinical practice guidelines for inflammatory bowel disease 2020 (Japanese Society of Gastroenterology). J Gastroenterol 2021;56(6):489-526.
16. Belgique, SPF Sécurité sociale. Arrêté royal du 18 juin 2017 modifiant l'article 24, § 1er, de la nomenclature des prestations de santé (dosage de la calprotectine, prestations 544751-544762, règle diagnostique 122). Moniteur belge, 13 juillet 2017, p. 72418.
17. Ananthakrishnan AN, Adler J, Chachu KA, et al. AGA Clinical Practice Guideline on the Role of Biomarkers for the Management of Crohn's Disease. Gastroenterology 2023;165(6):1367-1399.
18. Butler TD, Segal JP. Guideline review: 2025 British Society of Gastroenterology guidelines on inflammatory bowel disease in adults - Part 2: ulcerative colitis. Frontline Gastroenterol 2025 (doi 10.1136/flgastro-2025-103426). Revue de la recommandation BSG 2025 (Moran GW et al., Gut 2025;74(Suppl 2):s1-s101), dont le texte n'a pas pu être lu.
19. ECCO-ESGAR Guideline for Diagnostic Assessment in IBD Part 1: Initial diagnosis, monitoring of known IBD, detection of complications (ECCO 2019). Maaser C, Sturm A, Vavricka SR, et al. J Crohns Colitis. 2019;13(2):144-164.