Infection urinaire de l'enfant (fièvre sans foyer, pyélonéphrite, cystite)

Pédiatrie · Symptôme ou situation · mise à jour le 08/11/2026

Fréquence : 7,0 % des enfants de moins de 2 ans qui consultent pour une fièvre ^[1]

Fièvre inexpliquée ou signes urinaires, enfant de plus de 1 mois sans signe de gravité

Quand chercher une infection urinaire ? Devant une fièvre, la probabilité dépend des facteurs de risque : âge de moins de 3 mois, sexe masculin, antécédent de pyélonéphrite ou d'uropathie, fièvre isolée > 39 °C depuis plus de 48 heures ^[2]. L'ECBU n'est pas systématique chez l'enfant fébrile : il se fait chez l'enfant à haut risque (nouveau-né, uropathie, neutropénie) et en cas de signes urinaires ou de fièvre inexpliquée depuis au moins 48 heures ^[1].

Bandelette d'abord. Utilisable dès 1 mois ^[2]. Négative pour les leucocytes et les nitrites, elle rend l'infection très improbable (valeur prédictive négative > 90 %) et dispense de l'ECBU ; positive, elle impose un ECBU avant tout antibiotique ^[1,2]. Une antibiothérapie débutée trop tôt stérilise les urines et empêche ensuite d'affirmer le diagnostic ^[1,2].

Le mode de recueil fait le résultat. Taux de contamination : 50 à 60 % pour la poche, 25 % pour le milieu de jet, 10 % pour le sondage, 1 % pour la ponction sus-pubienne ^[1]. La poche reste acceptable quand la bandelette est franchement positive (leucocytes et nitrites), la probabilité d'infection étant alors très élevée ; dans les autres cas, préférer le milieu de jet (la stimulation sus-pubienne aide à l'obtenir chez le nourrisson), le sondage ou la ponction (grade A) ^[1,2]. Acheminer vite l'échantillon au laboratoire, à bonne température ^[1].

Lire l'ECBU (seuils de l'EAU/ESPU, en l'absence de seuil dans les recommandations françaises citées) ^[4] : une infection fébrile donne en général ≥ 10⁵ UFC/mL, mais le compte varie avec le mode de recueil, la diurèse, le délai et la température de conservation ; recueil propre, milieu de jet ou sondage : positif dès 10³ à 10⁴ UFC/mL d'un seul germe ; ponction sus-pubienne : tout compte est significatif ; culture polymicrobienne = contamination. Avant 4 mois chez l'enfant fébrile, 10³ UFC/mL suffit si la clinique et le recueil concordent. Leucocyturie avec culture stérile : antibiotique préalable, lithiase, corps étranger, tuberculose, Chlamydia ^[4].

Bilan sanguin : c'est un complément, en général réservé aux enfants hospitalisés ^[4] ; en ville, la seule indication retenue ici est la PCT quand un traitement oral d'emblée est envisagé ^[1].

Fébrile = pyélonéphrite. Toute infection urinaire fébrile est considérée et traitée comme une pyélonéphrite ^[2]. Traitement initial (pour mémoire) : ceftriaxone IM ou IV, ou amikacine (urgences, hôpital), ou céfixime oral d'emblée chez l'enfant à bas risque ; relais selon l'antibiogramme (cotrimoxazole après 1 mois, puis céfixime) ; 10 jours au total ^[1,2]. Adapter le traitement au plus tard dans les 36 à 48 heures si la souche est résistante ^[2].

Cystite (sans fièvre), surtout chez la fille de plus de 3 ans : ECBU systématique, puis traitement oral sans attendre le résultat (amoxicilline-acide clavulanique, cotrimoxazole ou céfixime), 5 jours au total ^[1,2] ; fosfomycine-trométamol en prise unique possible chez l'adolescente pubère sans uropathie ^[1].

Ailleurs dans le monde : aux États-Unis, la revue de l'AAFP (2020, corrigée après le retrait en 2021 de la recommandation de l'AAP de 2011, qui faisait de la couleur de peau un facteur de risque) exige une leucocyturie et une culture positive, au moins 50 000 UFC/mL sur sondage ou ponction chez le nourrisson fébrile selon l'AAP, et n'utilise la poche que pour écarter une infection, jamais pour la culture, en raison de 88 à 99 % de faux positifs ^[5]. En Australie, le guide du Royal Children's Hospital de Melbourne (2025) exclut aussi la poche pour la culture et retient la croissance d'un seul germe : > 10⁵ UFC/mL quel que soit le recueil, 10³ à 10⁵ UFC/mL sur sondage, tout compte sur ponction ^[6] (la poche admise en France quand la bandelette est franchement positive relève d'un autre arbitrage entre simplicité du recueil et faux positifs). Ni l'un ni l'autre ne prévoit de PCT ou de CRP ^[5,6] ; le guide australien fait pratiquer une hémoculture en cas de suspicion de sepsis ^[6].

Nourrisson de moins de 3 mois fébrile, ou enfant avec signe de gravité : urgences pédiatriques

Avant 3 mois, toute suspicion d'infection urinaire relève d'un avis pédiatrique en urgence, avec ECBU en urgence ^[3]. L'hospitalisation est recommandée avant 3 mois, en cas de suspicion de sepsis ou d'uropathie connue sévère ^[1] ; le traitement associe alors une céphalosporine de 3e génération injectable et l'amikacine ^[1,2].

Pas de bandelette seule avant 1 mois ni en cas de neutropénie ou de sepsis : l'ECBU se fait d'emblée ^[2].

Hémocultures avant l'antibiotique dans les formes sévères et chez les enfants à risque (moins de 3 mois, uropathie sous-jacente) ^[2].

Chez un enfant gravement malade, le prélèvement d'urines ne doit pas retarder le traitement ^[3].

Ailleurs dans le monde : les recommandations américaine et australienne concordent : analyse d'urines chez tout nourrisson de moins de 3 mois malade, fébrile ou non, pour la revue de l'AAFP ^[5] ; culture d'urines systématique avant 3 mois, et NFS, hémoculture et ponction lombaire chez le nourrisson de moins de 4 semaines fébrile et malade, pour le guide de Melbourne ^[6]. Ce guide fait hospitaliser pour une antibiothérapie intraveineuse initiale tout nourrisson de moins de 3 mois et tout enfant gravement malade ^[6].

Après l'épisode : contrôles et suivi

Pas de contrôle des urines chez un enfant guéri et sans symptôme ^[3]. Une bactériurie asymptomatique ne se traite pas et ne justifie aucun suivi ^[3].

Reflux vésico-urétéral : il est fréquent après une première infection (35 %) et plus encore après des infections récidivantes (75 %), le plus souvent de bas grade ; la plupart des reflux révélés par une pyélonéphrite ne relèvent ni d'une antibioprophylaxie ni d'un geste, et guérissent spontanément ^[2]. D'où l'absence de cystographie et d'antibioprophylaxie après un premier épisode, sauf situation particulière ^[2]. L'efficacité de l'antibioprophylaxie sur les récidives est controversée ; en 2015, les recommandations françaises relevaient qu'aucune étude ne montrait de réduction des cicatrices rénales, et elle sélectionne des bactéries résistantes ^[2]. Un essai suédois (2010, enfants de 1 à 2 ans avec reflux de grade III-IV) a toutefois observé de nouvelles cicatrices rénales chez 8 filles sous surveillance et aucune sous prophylaxie ^[7].

Imagerie après une infection fébrile : les recommandations divergent. L'EAU/ESPU recommande une échographie rénale et vésicale après toute infection fébrile (dans les 24 heures chez le nourrisson et l'enfant très malade, à distance chez l'enfant non hospitalisé), et de discuter une cystographie après une infection fébrile avant 1 an, une infection atypique ou récidivante, ou une échographie anormale ^[4]. NICE prévoit une échographie avant 6 mois (dans les 6 semaines si l'évolution est favorable), puis seulement en cas d'infection atypique ou récidivante ^[3]. Le GPIP ne prescrit pas de cystographie après une première pyélonéphrite, sauf situation particulière ^[2].

Prévention des récidives : traiter les troubles mictionnels et la constipation, faire boire suffisamment, permettre l'accès aux toilettes sans retenir les mictions ^[3].

Adresser à un pédiatre spécialisé en cas d'infections récidivantes ou d'imagerie anormale ; à un néphrologue pédiatre en cas d'anomalies rénales bilatérales, d'altération de la fonction rénale, d'HTA ou de protéinurie ^[3].

Ailleurs dans le monde : la revue américaine de l'AAFP (2020) fait faire une échographie rénale et vésicale à tout enfant de moins de 24 mois après une première infection fébrile, et une cystographie en cas de récidive ou d'échographie anormale ^[5] (recommandations fondées en partie sur des études d'observation). Le guide australien de Melbourne (2025) réserve l'échographie aux infections atypiques, aux récidives et au nourrisson de moins de 6 mois sans surveillance anténatale, la plupart des enfants n'en ayant pas besoin après une première infection ^[6]. Comme la fiche, la campagne américaine Choosing Wisely déconseille la culture d'urines de contrôle après une infection non compliquée guérie cliniquement ^[5]. La scintigraphie au DMSA, utilisée au Royaume-Uni, n'est pas recommandée aux États-Unis en dehors de la recherche ^[5].

Sources

1. Madhi F, Rybak A, Basmaci R, et al. ; Groupe de pathologie infectieuse pédiatrique (GPIP). Antimicrobial treatment of urinary tract infections in children. Infect Dis Now. 2023;53(8S):104786. Version française : Antibiothérapies curatives des infections urinaires de l'enfant. J Pediatr Pueric. 2024;37:150-157.
2. Cohen R, Raymond J, Faye A, Gillet Y, Grimprel E ; Société française de pédiatrie, Société de pathologie infectieuse de langue française. Prise en charge des infections urinaires de l'enfant. Recommandations du groupe de pathologie infectieuse pédiatrique de la SFP et de la SPILF. Arch Pediatr. 2015;22(6):665-671.
3. National Institute for Health and Care Excellence (NICE). Urinary tract infection in under 16s: diagnosis and management (NG224). 27 juillet 2022 ; recommandations 1.1.3, 1.1.12, 1.1.27, 1.2.8, 1.2.10-1.2.15, 1.3, 1.5.5-1.5.10.
4. Radmayr C, Bogaert G, Bujons A, et al. EAU Guidelines on Paediatric Urology, chapitre 12 « Urinary tract infections in children ». European Association of Urology, mise à jour limitée de mars 2026. Résumé publié : Gnech M, et al. Update and summary of the EAU/ESPU paediatric guidelines on urinary tract infection in children. J Pediatr Urol. 2026;22:105481 (PMID 40615247).
5. Veauthier B, Miller MV. Urinary Tract Infections in Young Children and Infants: Common Questions and Answers. Am Fam Physician. 2020;102(5):278-285 (version corrigée après le retrait, en mai 2021, de la recommandation de l'American Academy of Pediatrics de 2011, réaffirmée en 2016).
6. The Royal Children's Hospital Melbourne. Clinical Practice Guidelines : Urinary tract infection. Guide approuvé par le Paediatric Improvement Collaborative (Victoria, Australie), dernière mise à jour octobre 2025.
7. Brandström P, Nevéus T, Sixt R, Stokland E, Jodal U, Hansson S. The Swedish reflux trial in children: IV. Renal damage. J Urol. 2010;184(1):292-7.