Diarrhées chroniques
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Bilan biologique
- NFS
- CRP
- Ionogramme sanguin
- Créatininémie avec estimation du DFG
- TSH
- IgA anti-transglutaminase (après régime riche en gluten)
- IgA totales
- Examen parasitologique des selles 3 jours (si séjour en zone d'endémie, immunodépression ou début aigu)si besoinreco. étrangèreSéjour ou vie dans un pays en développement : l'UEG/ESNM propose de rechercher ces pathogènes chez ces patients [2]. Immunodépression : la BSG recommande l'examen de trois selles fraîches à la recherche d'œufs, de kystes et de parasites [1]. Début aigu faisant craindre une giardiase [2]. Devant une diarrhée d'allure fonctionnelle, la recherche systématique de pathogènes dans les selles n'est pas recommandée [2]. Hyperéosinophilie sanguine (> 500/mm³) chez un patient revenu d'un séjour exotique : examen parasitologique des selles, avec technique de Baermann à préciser sur la demande ; un examen coprologique isolé manque environ 9 anguilluloses sur 10 [3].
- Calprotectine fécale (suspicion d'inflammation intestinale, surtout avant 40 ans)si besoinnon rembourséRecherche d'une inflammation intestinale (MICI) ; utile surtout avant 40 ans quand on évoque un syndrome de l'intestin irritable. Non remboursée si prescrite par un généraliste.
- coproculture (avec recherche de Clostridium difficile si post-antibiothérapie)si besoinDiarrhée apparue pendant ou après une antibiothérapie : recherche de Clostridioides difficile.
- glycémie à jeunsi besoinreco. étrangèreEn seconde intention : le bilan initial de la BSG ne comporte pas de glycémie (NFS, ferritine, anticorps anti-transglutaminase ou anti-endomysium, bilan thyroïdien) et cite le diabète parmi les causes systémiques possibles, par dysautonomie [1] ; la diarrhée par neuropathie diabétique n'est pas un mode classique de révélation d'un diabète (avis des auteurs).
- Calcémiesi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- Albuminémiesi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- ASATsi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- ALATsi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- GGTsi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- PALsi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- TPsi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- Ferritinémiesi besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- Vitamine B9si besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- Vitamine B12si besoinSuspicion de malabsorption chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, préférer l'avis pour endoscopie.
- sérologie VIHsi besoinPatient immunodéprimé, ou facteur de risque ou forte prévalence du VIH dans sa population : la diarrhée chronique est fréquente lors de la découverte d'une infection par le VIH.
Toujours penser au réflexe iatrogène [1] (diarrhée sous metformine [4], colite microscopique sous IPP notamment lansoprazole [1,5], diarrhée à C. difficile après amoxicilline-acide clavulanique [6], etc.)
Les signes d’alarme sont : 50 ans ou plus – haut risque de cancer colo-rectal – modifications récentes du transit – AEG – masse abdominale – rectorragies – anémie [1,7]. Ils doivent inciter à aller rapidement vers un avis de gastro-entérologue pour bilan endoscopique.
La calprotectine fécale est recommandée largement [1], mais n’est pas remboursée si prescrite par un médecin généraliste (depuis février 2024, elle n'est remboursée que chez un patient dont la MICI est déjà diagnostiquée, sans rectorragie ni élévation de la CRP, si elle est prescrite par un hépato-gastroentérologue ou un pédiatre, dans la limite de 2 dosages par an) [8,9].
Les recommandations sont variées sur ce sujet, certains privilégiant une recherche du mode de diarrhée (par coprologie fonctionnelle), d’autres une recherche des principales étiologies comme ici : MICI, infection, maladie coeliaque, dysthyroïdie et cancer [1,10]. Par exemple, le NICE ne recommande pas la TSH en première intention [11]. La glycémie à jeun est plutôt en seconde intention : le bilan initial de la BSG ne la comprend pas et le diabète n'y figure que parmi les causes systémiques, par dysautonomie [1] ; la diarrhée par neuropathie diabétique n’est pas un mode classique de révélation d’un diabète (avis des auteurs).
L'examen parasitologique des selles n'est pas systématique : la recherche de pathogènes n'est pas recommandée devant une diarrhée d'allure fonctionnelle [2]. Il se discute après un séjour en zone d'endémie, devant un début aigu faisant craindre une giardiase [2] ou chez l'immunodéprimé ; il porte alors sur trois selles fraîches [1]. Devant une hyperéosinophilie au retour d'un séjour exotique, on l'associe à la technique de Baermann (anguillulose) [3].
Le bilan de malabsorption (calcémie, albuminémie, ASAT, ALAT, gGT, PAL, TP, ferritinémie, Vitamine B9, vitamine B12) [1] pourra plus volontiers être réalisé chez un patient jeune ; à partir de 50 ans, il apparait préférable d’envisager un bilan endoscopique, la coloscopie étant alors recommandée [2].
Pour les IgA anti-transglutaminase, il est recommandé d’effectuer un régime comprenant au moins 3g/j de gluten pendant 6-8 semaines pour éviter un faux négatif [12,13,14]. Le dosage des IgA totales accompagne toujours celui des IgA anti-transglutaminase en première intention, et aucun autre test sérologique n'est recommandé d'emblée [14].
Enfin, en cas de symptômes (diarrhée chronique), on évite ici la recherche de sang occulte dans les selles qui pourrait conduire à ne pas faire de coloscopie à tort. Les recommandations britanniques proposent au contraire un test immunologique fécal quantitatif (FIT) chez le patient symptomatique sans rectorragie, pour écarter un cancer ou hiérarchiser les explorations [1,7] ; ce test n’a pas d’acte à la NABM (version 105) [9].
Ailleurs dans la francophonie : au Québec, l'INESSS recommande de rechercher les parasites intestinaux (Giardia, Cryptosporidium, Entamoeba histolytica, Dientamoeba fragilis) par un test d'amplification des acides nucléiques en multiplex, sur un seul échantillon de selles ; deux à trois prélèvements ne restent nécessaires que si le parasite recherché relève de la microscopie [15].
Ailleurs dans le monde : aux États-Unis, une revue de l'American Family Physician propose un bilan initial voisin (NFS, CRP, IgA anti-transglutaminase, IgA totales et bilan métabolique de base) et ne demande la TSH que devant des signes évocateurs d'une maladie endocrinienne [16], alors que la BSG place le bilan thyroïdien et la ferritine dans le premier bilan sanguin [1] (choix différents des sociétés savantes). Si ce premier bilan n'oriente pas, cette revue classe la diarrhée en hydrique, graisseuse ou inflammatoire à l'aide d'un test immunologique fécal, d'une calprotectine ou d'une lactoferrine fécale et d'une recherche de graisses dans les selles [16]. Devant une suspicion de giardiase, elle préfère la recherche d'antigène dans les selles, plus sensible que l'examen parasitologique [16]. La malabsorption des acides biliaires se recherche dans d'autres pays par le test au SeHCAT, non autorisé aux États-Unis, où le C4 et le FGF19 sériques sont présentés comme des tests initiaux prometteurs là où ils sont disponibles [16] ; l'antigène de Giardia, la lactoferrine fécale et le C4 n'ont pas d'acte à la NABM [9] (offre d'examens différente).
Enfant : diarrhée chronique avec retentissement sur la croissance
Bilan biologique
- NFS
- CRP
- Albuminémie
- IgA anti-transglutaminase
- IgA totales
- Ferritinémie (si pâleur ou anémie)si besoinPâleur ou anémie : une carence en fer peut révéler une maladie cœliaque, et l'anémie oriente vers une MICI [17].
- Élastase fécale (si selles graisseuses ou hyperphagie)si besoinSelles graisseuses ou hyperphagie compensatrice : éliminer une insuffisance pancréatique exocrine [17].
Diarrhée chronique : au-delà de 3 semaines d'évolution [17]. Écarter d'abord la fausse diarrhée de l'enfant constipé (selles molles et dures, encoprésie), les selles grumeleuses de l'enfant au sein et les selles vertes sous préparation hydrolysée ; des selles la nuit plaident pour une cause organique (sauf chez le jeune nourrisson) [17].
Sans retentissement sur la croissance : diarrhée a priori fonctionnelle (cause la plus fréquente, typiquement de 6 mois à 3 ans, enfant en parfait état) ; aucun examen n'est nécessaire [17]. En cas de doute (hyperphagie, selles graisseuses), une élastase fécale peut éliminer une insuffisance pancréatique exocrine [17].
Avec retentissement pondéral, penser chez le jeune nourrisson à l'allergie aux protéines du lait de vache, à la mucoviscidose et à la maladie cœliaque (si le gluten est introduit) ; chez le préadolescent et l'adolescent, à la maladie cœliaque et aux MICI [17]. La mucoviscidose révélée par une diarrhée est devenue rarissime depuis le dépistage néonatal, mais reste à évoquer en raison des faux négatifs [17]. Les diarrhées du nouveau-né relèvent du spécialiste [17].
Maladie cœliaque : IgA anti-transglutaminase avec IgA totales, chez un enfant qui consomme du gluten ; si les IgA totales sont basses, IgG anti-transglutaminase [17,18]. Tout résultat positif est adressé au gastropédiatre ; si les IgA anti-transglutaminase dépassent 10 fois la normale, le diagnostic peut se passer de biopsie à condition que les anticorps anti-endomysium soient positifs sur un deuxième prélèvement [17,18]. Ne pas débuter le régime sans gluten avant la confirmation [17]. Voir la fiche « Maladie cœliaque ».
MICI : syndrome inflammatoire, anémie, hypoalbuminémie et échographie orientent ; adresser au gastropédiatre [17].
Ailleurs dans le monde : au Royaume-Uni, le NICE propose aussi la sérologie de la maladie cœliaque devant des symptômes digestifs persistants inexpliqués ou un retard de croissance, avec chez l'enfant les IgA totales et les IgA anti-transglutaminase en premier choix, puis adresse l'enfant dont la sérologie est positive au pédiatre gastro-entérologue [12], comme l'ESPGHAN [18].
Ne pas prescrire
- Anticorps anti-peptides de gliadine désamidée (DGP IgG/IgA) en première intention : l'ESPGHAN recommande de ne pas les utiliser ; un test IgG ne se discute que si les IgA totales sont basses ou indétectables [18].
- Typage HLA DQ2/DQ8 : n'est pas un critère obligatoire du diagnostic de maladie cœliaque [18].
Sources
- Arasaradnam RP, Brown S, Forbes A, Fox MR, Hungin P, Kelman L, et al. Guidelines for the investigation of chronic diarrhoea in adults: British Society of Gastroenterology, 3rd edition. Gut 2018;67(8):1380-1399.
- Savarino E, Zingone F, Barberio B, Marasco G, Akyuz F, Akpinar H, et al. Functional bowel disorders with diarrhoea: Clinical guidelines of the United European Gastroenterology and European Society for Neurogastroenterology and Motility. United European Gastroenterol J 2022;10(6):556-584.
- Magnaval J-F. Conduite à tenir devant la découverte d'une hyperéosinophilie chez un voyageur. Med Trop (Mars) 2003;63:131-133.
- Agence nationale de sécurité du médicament, base de données publique des médicaments. Glucophage 500 mg, comprimé pelliculé (metformine) : résumé des caractéristiques du produit, rubriques 4.4 et 4.8.
- Miehlke S, Guagnozzi D, Zabana Y, Tontini GE, Kanstrup Fiehn AM, Wildt S, et al. European guidelines on microscopic colitis: United European Gastroenterology and European Microscopic Colitis Group statements and recommendations. United European Gastroenterol J 2021;9(1):13-37.
- Agence nationale de sécurité du médicament, base de données publique des médicaments. Augmentin 500 mg/62,5 mg, comprimé pelliculé (amoxicilline/acide clavulanique) : résumé des caractéristiques du produit, rubriques 4.4 et 4.8.
- National Institute for Health and Care Excellence. Suspected cancer: recognition and referral. NICE guideline NG12, 23 juin 2015, mise à jour du 15 avril 2026 : section 1.3 (cancers colorectaux).
- Remboursement de la calprotectine fécale
- Assurance maladie. Nomenclature des actes de biologie médicale (NABM), version 105 : examens des selles.
- Schiller LR, Pardi DS, Sellin JH. Chronic Diarrhea: Diagnosis and Management. Clin Gastroenterol Hepatol 2017;15(2):182-193.e3.
- National Institute for Health and Care Excellence. Irritable bowel syndrome in adults: diagnosis and management. Clinical guideline CG61, 23 février 2008, mise à jour du 4 avril 2017.
- National Institute for Health and Care Excellence. Coeliac disease: recognition, assessment and management. NICE guideline NG20, 2 septembre 2015.
- Al-Toma A, Zingone F, Branchi F, Schiepatti A, Malamut G, Canova C, et al. European Society for the Study of Coeliac Disease 2025 Updated Guidelines on the Diagnosis and Management of Coeliac Disease in Adults. United European Gastroenterol J 2025;13(10):1855-1886.
- Haute Autorité de santé. Maladie cœliaque : diagnostic chez l'enfant et l'adulte. Recommandation de bonne pratique, validée par le Collège le 16 juillet 2026.
- Institut national d'excellence en santé et en services sociaux (INESSS). Analyses microbiologiques des selles en cas de diarrhée chez l'adulte et l'enfant : pertinence et pistes d'action pour une utilisation judicieuse. Avis, décembre 2021.
- Burgers K, Lindberg B, Bevis ZJ. Chronic Diarrhea in Adults: Evaluation and Differential Diagnosis. Am Fam Physician. 2020;101(8):472-480.
- Collège national des pédiatres universitaires (CNPU). Référentiel de pédiatrie, chapitre 20 : Diarrhée chronique.
- Husby S, Koletzko S, Korponay-Szabó I, Kurppa K, Mearin ML, Ribes-Koninckx C, et al. European Society Paediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition guidelines for diagnosing coeliac disease 2020. J Pediatr Gastroenterol Nutr 2020;70(1):141-156.
- EBM France : diarrhée chronique
- Chapman T P, Chen L Y, Leaver L. Investigating young adults with chronic diarrhoea in primary care BMJ 2015; 350 :h573
- RecoMédicale : diarrhée chronique
- Grillot J. et al. Conduite à tenir pratique pour l’exploration d’une malabsorption, d’une maldigestion, et d’une entéropathie exsudative
- Biesiekierski, Jessica R et al. Non-coeliac gluten sensitivity. The Lancet, Volume 406, Issue 10518, 2494 - 2508